K ohrožení komunikací a objektů na nábřeží dochází při méně jak desetileté povodni a roudnický most se ukázal v r. 2002 jako velmi strategická stavba, neboť byl jediným mostem mezi Prahou a státní hranicí se SRN, který i v době kulminace povodně spojoval oba břehy a umožňoval dopravu humanitární pomoci do postižených oblastí. 

Původní záměr předpokládal ochranu města na úroveň Q100 a ochranu areálu Pod Lípou vč. severního předmostí na úroveň Q20, resp. Q2002. Pro ochranu města se počítalo s využitím drážního tělesa ČD, které tvoří přirozený zemní val mezi řekou a městem. Město nechalo zpracovat rizikovou analýzu vyhodnocení vlivu stavby na životní prostředí, byla posouzena ekonomická efektivnost, v r. 2007 vydáno územní rozhodnutí a v následujícím roce byla akce zahrnuta do programu MZe ČR Podpory prevence před povodněmi II.  V další fázi proběhlo na základě požadavku Českých drah hydrostatické posouzení drážního tělesa, zda toto může být využito jako existující zemní hráz proti povodňové vlně na Labi. Expertíza byla zpracována v prosinci 2008, bohužel s negativním závěrem, a to především z důvodu nehomogenity materiálu náspu a z toho plynoucí vysoké pravděpodobnosti sufózních jevů, což by ve svém důsledku vedlo k porušení geometrie kolejiště, případně až k destrukci drážního tělesa. 

Z uvedeného důvodu bylo nutno opustit variantu využití drážního tělesa ČD a v letech 2009-10 proto byly zvažovány jiné možnosti ochrany města. Diskutována byla především varianta ochrany mobilními protipovodňovými zábranami, podobně jako je tomu na Střekově anebo na pražském nábřeží. Zároveň proběhlo důkladné posouzení poškození mostu přes Labe po povodni v r. 2002 a vyhodnocení ekonomických přínosů zachování provozu na silnici č.II/240 právě díky odolnosti mostu proti účinku velkých vod. Současně bylo upuštěno od záměru ochrany basketbalové sportovní haly. Výsledkem je finální návrh úprav na kanalizační síti v ulicích Havlíčkově a Poděbradově, možnost ochrany nemovitostí pomocí plastových mobilních zábran, které budou umístěny na komunikacích a doplněny čerpadly pro přečerpávání podtékající a prosakující vody. Tím bude zajištěna maximální technicky možná a ekonomicky únosná ochrana intravilánu Roudnice nad Labem. Na pravém břehu dojde k položení izolace (vč. stavby podzemní larsenové stěny) na návodní straně silničního náspu tak, aby tento byl odolný proti dynamickým i statickým vlivům povodně v úrovni Q2002.

Další postup prací byl podmíněn uzavřením smlouvy o účasti města Roudnice nad Labem v programu Podpora prevence před povodněmi II. Právě tato smlouva byla jedním z bodů, které projednalo na svém zasedání 30. března 2011 zastupitelstva města. Na základě jejího schválení může ministerstvo zemědělství rozhodnout o příslibu finančních prostředků ze státního rozpočtu a z EIB, což ve finále umožní realizovat protipovodňovou ochranu města s rozpočtem cca 47 mil. korun s pouhými 5% finanční spoluúčasti města. Kromě vlastní protipovodňové ochrany dojde také ke zhodnocení finančních prostředků, které město již vložilo do přípravy projektu.